RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0U1RQV5	110 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GUH1	482 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ICMT	O60725	284 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA5	P05154	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CBR1	P16152	277 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR3DL2	P43630	455 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TPTE	P56180	551 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	FABP5	Q01469	135 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL9	Q6T311	187 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR31	Q8NA23	367 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD17B8	Q92506	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	HTRA1	Q92743	480 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A096LPE4	126 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PPZ6	126 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		J3QW42	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRP	O00591	440 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV3-15	P01624	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-H	P01893	362 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	UCHL1	P09936	223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ACHE	P22303	614 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CCL1	P22362	96 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD11B1	P28845	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PLP2	Q04941	152 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	MTFR2	Q6P444	385 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RGCC	Q9H4X1	137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF121	Q9H920	327 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		M0R135	149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	DOK2	O60496	412 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ATE1	O95260	518 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV1-44	P01699	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TTR	P02766	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF12	P17014	697 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBG1	P23258	451 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CX3CR1	P49238	355 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKX	P51817	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms