RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHLHE23Q8NDY6 225 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T12Q8NG77 320 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LZICQ8WZA0 190 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT4Q9H2B2 425 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC134Q9H6E4 229 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCH7Q9H992 704 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOX4Q9NPH5 578 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.98□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOTCH1P46531 2555 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FFAR1O14842 300 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RER1O15258 196 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A7O60669 478 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA7O95182 113 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYBA1P05813 215 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELEP16581 610 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPIFB3P59826 476 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RELBQ01201 579 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBED5Q49AG3 693 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRICD5Q6PL45 260 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6YL49 198 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCDC5Q6ZRR9 648 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLB1L2Q8IW92 636 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CITED1Q99966 193 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHIAQ9BZP6 476 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RERGLQ9H628 205 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1RLQ9NZP8 487 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.97□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GWJ7 208 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C22orf46C9J442 243 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0QZ24 198 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EBAG9O00559 213 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENSAO43768 121 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF2P14316 349 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDHAP31040 664 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMELP40967 661 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GATA4P43694 442 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM86BQ8N661 226 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ7Q99807 217 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM107BQ9H098 131 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDHD2Q9H0R4 259 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP27Q9H306 513 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGBPQ9NV56 204 aa10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNK1Q9H4A3 2382 aa10.96□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMPA2O14732 288 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DPB1P04440 258 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MELTFP08582 738 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FPR3P25089 353 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF10Q13118 480 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPRE2Q15555 327 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNMB1Q16558 191 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF841Q6ZN19 808 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCK1Q86TW2 530 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8TCH9 128 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUAK2Q9H093 628 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR76Q9H967 626 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM100Q9NV29 134 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GID8Q9NWU2 228 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.95□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM23O14925 209 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFB2O95178 105 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFTPBP07988 381 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFHR2P36980 270 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMB10P40306 273 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPY4RP50391 375 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD23AP54725 363 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H3AP68431 136 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAB21L1Q13394 359 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFI44LQ53G44 452 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.94□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms