RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS14Q96SY0 518 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RASGRP1O95267 797 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GFERP55789 205 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 H3F3AP84243 136 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZP4Q12836 540 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMYND11Q15326 602 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 POFUT1Q9H488 388 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HSF4Q9ULV5 492 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 F5H5P2 479 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PLPP3O14495 311 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNAB3O43448 404 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TSC22D2O75157 780 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RBBP9O75884 186 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3AP20336 220 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LIN54Q6MZP7 749 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K3Q99759 626 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GINS4Q9BRT9 223 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TINAGQ9UJW2 476 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF3C1Q12789 2109 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FRG2CA6NGY1 282 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01565O15544 149 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ICOSLGO75144 302 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAPC5O75971 98 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAPINO95295 136 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM50AO95807 157 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 F12P00748 615 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR2CP28335 458 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXL2P58012 376 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CTXN1P60606 82 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC61Q9BV99 259 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NBASA2RRP1 2371 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GVT2 93 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRA5A6NI73 299 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAMP1O60894 148 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MAS1P04201 325 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAIN1P0CW23 69 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF28P17035 718 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD11B1P28845 292 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GSK3AP49840 483 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 AP3S2P59780 193 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PMPCAQ10713 525 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCL4Q6XD76 172 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF8Q7Z7C8 310 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LYG2Q86SG7 212 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LRTM2Q8N967 370 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BADQ92934 168 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.21□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF4P43489 277 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H3AP68431 136 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52W1Q6IF63 320 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCC3Q6UW78 93 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MTSS1LQ765P7 747 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8NFD4 153 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8K3Q8NH51 312 aa3.2□□□□□ -1.9
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