RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.2□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R135 149 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SSX4O60224 188 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 LCATP04180 440 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSM4P0C7M7 580 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC6A9P48067 706 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MALLQ13021 153 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIP10Q15642 601 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.19□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 LRP11Q86VZ4 500 aa13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 OTOSQ8NHW6 89 aa13.19□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 KCNJ15Q99712 375 aa13.19□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa13.19□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 SNTNA6NMZ2 147 aa13.18□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 HSD11B1P28845 292 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH3B1P43353 468 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TMED1Q13445 227 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 COLCA1Q6ZS62 124 aa13.18□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 HAVCR1Q96D42 359 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MNTQ99583 582 aa13.18□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC29A1Q99808 456 aa13.18□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 MPV17P39210 176 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 POU4F2Q12837 409 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 GGTLC2Q14390 218 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF283Q8N7M2 679 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CMBLQ96DG6 245 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DIRC2Q96SL1 478 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 NIPAL2Q9H841 368 aa13.17□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
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PGGT1B-202ENST00000379615 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC182A6NF36 153 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf100A8MU93 164 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 M0R129 80 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PHYHO14832 338 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 FOSL1P15407 271 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ALOX5APP20292 161 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KITLGP21583 273 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR1FP30939 366 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1E1P36543 226 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PDLIM4P50479 330 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF81P51508 661 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKXP51817 358 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PSG7Q13046 419 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM209AQ5JX71 171 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A30Q5SVS4 291 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DEGS2Q6QHC5 323 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATC1Q76KD6 591 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF555Q8NEP9 628 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM168AQ92567 244 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 VCXQ9H320 206 aa13.16□□□□□ -0.3
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