RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 M0R1B8 84 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 TRIB1Q96RU8 372 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 XKRY2A2RUG3 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 DPF1Q92782 380 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ISL2Q96A47 359 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 C10orf90Q96M02 699 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ATF6BQ99941 703 aa14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM202A6NGA9 273 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 TRIM77I1YAP6 450 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 GPR37O15354 613 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 FAM157BP0CG42 384 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 BPIFB3P59826 476 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 DOC2BQ14184 412 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CADM3Q8N126 398 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MFSD4AQ8N468 514 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ST8SIA4Q92187 359 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 S1PR3Q99500 378 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 A0A0A6YYJ9 748 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 M0R135 149 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 AQP8O94778 261 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 KLKB1P03952 638 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PSMB6P28072 239 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SAXO2Q658L1 398 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 DRAM2Q6UX65 266 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF799Q96GE5 643 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 HES7Q9BYE0 225 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 GPR84Q9NQS5 396 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 BAK1Q16611 211 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ARSGQ96EG1 525 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 DLL4Q9NR61 685 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 LRP3O75074 770 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 NRASP01111 189 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 NID1P14543 1247 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 BAMBIQ13145 260 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SDF2Q99470 211 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RAB18Q9NP72 206 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ACER3Q9NUN7 267 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CBY3A6NI87 242 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 NUDT19A8MXV4 375 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 HMGN4O00479 90 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR2J2O76002 312 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CD27P26842 260 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SDHAP31040 664 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 HOXC8P31273 242 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM230Q96A57 120 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.62□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 K7ESM1 405 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PRRG2O14669 202 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC39A7Q92504 469 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PSENENQ9NZ42 101 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 DAPP1Q9UN19 280 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 TJP1Q07157 1748 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 RAF1P04049 648 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ARNTP27540 789 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PMP22Q01453 160 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF425Q6IV72 752 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CMBLQ96DG6 245 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 ASAH1Q13510 395 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PCK2Q16822 640 aa14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR2A14Q96R47 310 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms