RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC107Q8WV48 283 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 KCNK17Q96T54 332 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 UCK1Q9HA47 277 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 UPB1Q9UBR1 384 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DMDP11532 3685 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GX78 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PP11 408 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR14I1A6ND48 311 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR2AT4A6NND4 320 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TTLL8A6PVC2 850 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 METTL12A8MUP2 240 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 LMO7DNF2Z398 122 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RAB27BO00194 218 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 EFNA2O43921 213 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HPP00738 406 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 APOC3P02656 99 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ABOP16442 354 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 AKR1C4P17516 323 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BDKRB2P30411 391 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CALCRP30988 508 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HRH1P35367 487 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DLSTP36957 453 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MFAP5Q13361 173 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TDGQ13569 410 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC51BQ86UW2 128 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 COMMD2Q86X83 199 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PXT1Q8NFP0 134 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 AQP3Q92482 292 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 THRSPQ92748 146 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 EDEM2Q9BV94 578 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FGF21Q9NSA1 209 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FAM206AQ9NX38 181 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0A6YYD4 124 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PNR3 127 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 RNF222A6NCQ9 220 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 D6RAR5 112 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SULT1C2O00338 296 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SYT7O43581 403 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR2T1O43869 369 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SSX5O60225 188 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RAMP1O60894 148 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PIAS2O75928 621 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CD74P04233 296 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 VSIG8P0DPA2 414 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NAGAP17050 411 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BCKDHBP21953 392 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB25P24278 435 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PRKXP51817 358 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CLDN6P56747 220 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NXPH1P58417 271 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 COL19A1Q14993 1142 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TOMM20Q15388 145 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BANF2Q9H503 90 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CHST11Q9NPF2 352 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.47□□□□□ -1.37
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