RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 LINC01590Q5TEZ4 76 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MISPQ8IVT2 679 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM234Q8WY98 164 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 KCTD7Q96MP8 289 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 BEX1Q9HBH7 125 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 WIF1Q9Y5W5 379 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 A0A075B6Q4 140 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TVP23AA6NH52 213 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TSTD3H0UI37 97 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 GABRPO00591 440 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 KRT33AO76009 404 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SERPINA3P01011 423 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ALDOBP05062 364 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 HLA-DOBP13765 273 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 RORCP51449 518 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NTRK2Q16620 822 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 OR6V1Q8N148 313 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SVBPQ8N300 66 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 RNF24Q9Y225 148 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.86□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 EFNA2O43921 213 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NCR1O76036 304 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 AHSA1O95433 338 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MT-ND5P03915 603 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 OR7A5Q15622 319 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 GUCA2BQ16661 112 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 FREM3P0C091 2139 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NUDT19A8MXV4 375 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 C9orf172C9J069 976 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 DKK1O94907 266 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SDHBP21912 280 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ACSM1Q08AH1 577 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 CAMK2DQ13557 499 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MELKQ14680 651 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ACKR1Q16570 336 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ASB18Q6ZVZ8 466 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 STRADBQ9C0K7 418 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TCFL5Q9UL49 500 aa11.85□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PPE3 182 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 PRR32B1ATL7 298 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TFPIP10646 304 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SGCBQ16585 318 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 CT55Q8WUE5 264 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 HLA-DPB1P04440 258 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 PSMB10P40306 273 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 RNF138Q8WVD3 245 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ST8SIA1Q92185 356 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MED9Q9NWA0 146 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 GNG8Q9UK08 70 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 CASKO14936 926 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 GLCEO94923 617 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 OR6A2O95222 327 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 MT-ATP6P00846 226 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 CD2P06729 351 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ACTC1P68032 377 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 ACTA1P68133 377 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 NHLH2Q02577 135 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 IL18Q14116 193 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 GGTLC2Q14390 218 aa11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C9orf106-201ENST00000316786 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms