RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF799Q96GE5 643 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PKMYT1Q99640 499 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HCSTQ9UBK5 93 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 AK3Q9UIJ7 227 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CLDN15P56746 228 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SLC17A1Q14916 467 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 BAK1Q16611 211 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MFSD4AQ8N468 514 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 DVL1O14640 695 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OMGP23515 440 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HCCSP53701 268 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ISL1P61371 349 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PPP1CAP62136 330 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ADIRFQ15847 76 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ACKR1Q16570 336 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RNF212Q495C1 297 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SLC7A6Q92536 515 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 DDOQ99489 341 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 DUSP13Q9UII6 198 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A20A6NK97 555 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SERPINE3A8MV23 424 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 IDSB3KWA1 339 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 M0QZ24 198 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FGF17O60258 216 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ICMTO60725 284 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NDUFB7P17568 137 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A1P53007 311 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CLDN20P56880 219 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FUT7Q11130 342 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CLINT1Q14677 625 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CDH26Q8IXH8 852 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TMEM99Q8N816 258 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 ZNF511Q8NB15 262 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CXorf58Q96LI9 332 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 Q96M85 177 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CHST6Q9GZX3 395 aa6.56□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FAM166BA8MTA8 275 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 M0R1B8 84 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TFAP2AP05549 437 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PTAFRP25105 342 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR10A3P58181 314 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SLC35A2P78381 396 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SSX7Q7RTT5 188 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 COMMD1Q8N668 190 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 FAM117AQ9C073 453 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 BCORQ6W2J9 1755 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CRYAAP02489 173 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CTRB1P17538 263 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CCR6P51684 374 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 NDUFA6P56556 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 EDDM3AQ14507 147 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CDK5R1Q15078 307 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 LYG2Q86SG7 212 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 DPF1Q92782 380 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 YIPF6Q96EC8 236 aa6.55□□□□□ -1.36
CPS1-201ENST00000233072 C2orf50Q96LR7 162 aa6.55□□□□□ -1.36
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