RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636966.1

CACNA1A-232, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA1A, Length 3,938 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-232ENST00000636966 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 MRI1Q9BV20 369 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.31□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM172BPA6NC97 362 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 A6NJY4 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RBBP9O75884 186 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 GSTT2P0CG29 244 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 EGR3Q06889 387 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RAB11BQ15907 218 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 STK35Q8TDR2 534 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ST8SIA1Q92185 356 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TRIM63Q969Q1 353 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 EMC6Q9BV81 110 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 MED29Q9NX70 200 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 VPS13CQ709C8 3753 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 NME2P1O60361 137 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 BGLAPP02818 100 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TCRBP04435 133 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ITGB2P05107 769 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ALOX5APP20292 161 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 CNR1P21554 472 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 NME2P22392 152 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 HSD11B1P28845 292 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 CCR6P51684 374 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 CLDN20P56880 219 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 LINC00303Q3SY05 128 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 C11orf88Q6PI97 169 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 PXKQ7Z7A4 578 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 BEST4Q8NFU0 473 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 OTOSQ8NHW6 89 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SNX18Q96RF0 628 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 A0A087WV48 116 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RAMP1O60894 148 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 S100A1P23297 94 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 HLA-DMAP28067 261 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 UQCRC1P31930 480 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 MAGEA5P43359 124 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RRADP55042 308 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 BIDP55957 195 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 CHST4Q8NCG5 386 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TAAR6Q96RI8 345 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 CHIAQ9BZP6 476 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 OR10A4Q9H209 315 aa7.3□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 UBE2QL1A1L167 161 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 LANCL1O43813 399 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 CTLA4P16410 223 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF43P17038 809 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 B2MP61769 119 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC17A1Q14916 467 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ETFDHQ16134 617 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TBR1Q16650 682 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RAET1LQ5VY80 246 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 FAM122BQ7Z309 247 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TIGD4Q8IY51 512 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 UPRTQ96BW1 309 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 OR51J1Q9H342 316 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.29□□□□□ -1.24
CACNA1A-232ENST00000636966 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.29□□□□□ -1.24
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