RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 LAMP5Q9UJQ1 280 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 VANGL2Q9ULK5 521 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZANQ9Y493 2812 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 KMT2AQ03164 3969 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 LCTP09848 1927 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 GABRR3A8MPY1 467 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 A8MXQ7 604 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLDN5O00501 218 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHMP2AO43633 222 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEMA3DO95025 777 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ETHE1O95571 254 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-53P01767 116 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 FGF1P05230 155 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABHD2P08910 425 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IMPDH1P20839 514 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC2A5P22732 501 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 AHCYP23526 432 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 MMP11P24347 488 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSMA2P25787 234 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSPA1LP34931 641 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 COILP38432 576 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CEACAM3P40198 252 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CASP3P42574 277 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRMT2P55345 433 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 SYNJ2BPP57105 145 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAS2R43P59537 309 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLHL40Q2TBA0 621 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM104BQ5XKR9 115 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 NIPAL3Q6P499 406 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAF8Q7Z7C8 310 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 MOB3BQ86TA1 216 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACOT1Q86TX2 421 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERO1BQ86YB8 467 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 SBSPONQ8IVN8 264 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 MSRB3Q8IXL7 192 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR8H3Q8N146 312 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM71CQ8NEG0 241 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 EXOC6Q8TAG9 804 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 LMX1AQ8TE12 382 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT35Q92764 455 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 YIPF5Q969M3 257 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 EEF2KMTQ96G04 330 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRIB3Q96RU7 358 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF251Q9BRH9 671 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 LRRC19Q9H756 370 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 DYRK4Q9NR20 520 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 INIPQ9NRY2 104 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAS2R5Q9NYW4 299 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMCO1Q9UM00 188 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 B9D1Q9UPM9 204 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGF2RP11717 2491 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1W2PRV1 198 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 LRP5LA4QPB2 252 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 IZUMO1RA6ND01 250 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 TOM1O60784 492 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ENTPD6O75354 484 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5H8P0DN80 308 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CALM1P0DP23 149 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CALM2P0DP24 149 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CALM3P0DP25 149 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 NT5EP21589 574 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHMLP26374 656 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPIP34949 423 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 FDFT1P37268 417 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRPHP41219 470 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 P2RX1P51575 399 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 NAPAP54920 295 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSG4Q00888 419 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 DHRS2Q13268 280 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 ILKQ13418 452 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 C1orf61Q13536 156 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLINT1Q14677 625 aa-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms