RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL22Q53GT1 634 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF773Q6PK81 442 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT77Q7Z794 578 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FNDC8Q8TC99 324 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MYDGFQ969H8 173 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PELI1Q96FA3 418 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8B4Q96RC9 309 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX7Q9BT81 388 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGMQ9H3S5 423 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 POFUT1Q9H488 388 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SIAEQ9HAT2 523 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 COQ3Q9NZJ6 369 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF319Q9P2F9 582 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GNG8Q9UK08 70 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP12Q9Y561 859 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.24□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5H1A6NKK0 313 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R1B8 84 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL12BO14950 172 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SGCEO43556 437 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LMX1BO60663 402 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFAIP8O95379 198 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HRGP04196 525 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 H2BFMP0C1H6 154 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T7P0C7T2 308 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HSMCR30P0CW71 290 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NR2C1P13056 603 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL12AP19105 171 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 NPR2P20594 1047 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB9P28065 219 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 UGT2B10P36537 528 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KIR3DL2P43630 455 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HTR5AP47898 357 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ASCL1P50553 236 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVS71-1P61550 626 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB1AP62820 205 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H3AP68431 136 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TMED1Q13445 227 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 AQP6Q13520 282 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GALEQ14376 348 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 INSL4Q14641 139 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF13Q15543 124 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PCK2Q16822 640 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 GSG1Q2KHT4 349 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 CDONQ4KMG0 1287 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL9Q6T311 187 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM57BQ71RH2 274 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RDH10Q8IZV5 341 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T27Q8NH04 317 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX33Q8WV41 574 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB5Q8WWX0 329 aa5.23□□□□□ -1.57
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