RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RASD2	Q96D21	266 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	COG8	Q96MW5	612 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	MIOX	Q9UGB7	285 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931		F5H5P2	479 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	XKRY	O14609	159 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RER1	O15258	196 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PMEL	P40967	661 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PITPNB	P48739	271 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS12	P56730	875 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RELB	Q01201	579 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAM2	Q15035	370 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	COQ5	Q5HYK3	327 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FITM2	Q8N6M3	262 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2T12	Q8NG77	320 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF570	Q96NI8	536 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RERGL	Q9H628	205 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	AHCYL1	O43865	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC16A7	O60669	478 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	KNG1	P01042	644 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	NPPA	P01160	153 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	IFNW1	P05000	195 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	CPT2	P23786	658 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	IFNA8	P32881	189 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RAG2	P55895	527 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF12	P61328	243 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF10	Q13118	480 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OCLN	Q16625	522 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBED5	Q49AG3	693 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8B2	Q96RD0	313 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR76	Q9H967	626 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	C22orf46	C9J442	243 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931		J3QW42	95 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	SOCS2	O14508	198 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FSTL3	O95633	263 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	RGS6	P49758	472 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	MEP1B	Q16820	701 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6YL49	198 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.47	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms