RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 PIGTQ969N2 578 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CCL19Q99731 98 aa14.74□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 OR51B6Q9H340 312 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CMAHPQ9Y471 501 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.74□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 OR4A8P0C604 315 aa14.73□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 NUDT6P53370 316 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.73□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 ADI1Q9BV57 179 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CENPMQ9NSP4 180 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF878C9JN71 531 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 F5H5K5 113 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 H0YAE9 185 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 H0YJX3 145 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ENTPD6O75354 484 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 NGFP01138 241 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 LCKP06239 509 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 LYNP07948 512 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 POU4F2Q12837 409 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 EFNB3Q15768 340 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 MSMPQ1L6U9 139 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 MST1LQ2TV78 715 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF691Q5VV52 312 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ABHD4Q8TB40 342 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 THEM6Q8WUY1 208 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 SPTSSAQ969W0 71 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 VCX3BQ9H321 246 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 AASSQ9UDR5 926 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 B9A039 149 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 J3QW42 95 aa14.71□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 ACSM4P0C7M7 580 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CAPGP40121 348 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 SLC15A1P46059 708 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 RGS6P49758 472 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 HCCSP53701 268 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 TPTEP56180 551 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 ERVS71-1P61550 626 aa14.71□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 TAF13Q15543 124 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.71□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 PLK3Q9H4B4 646 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-203ENST00000543002 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.71□□□□□ -0.05
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RABGGTA-203ENST00000543002 SNTNA6NMZ2 147 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 M0R135 149 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 CLIC3O95833 236 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF250P15622 560 aa14.7□□□□□ -0.06
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RABGGTA-203ENST00000543002 OPRL1P41146 370 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 EVX1P49640 407 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 IL5RAQ01344 420 aa14.7□□□□□ -0.06
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