RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAB21L1Q13394 359 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNJ8Q15842 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC153Q494R4 210 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA1AQ53H76 456 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8N7P7 452 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DTX3Q8N9I9 347 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUF2Q9BZD4 464 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR76Q9H967 626 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4Q9UBX2 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JPF8 293 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SASH3O75995 380 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-ATP6P00846 226 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2ABP04908 130 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAC2P15153 192 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACADSP16219 412 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A3P33764 101 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB5P36952 375 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB13P51153 203 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2E1P51965 193 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DSTNP60981 165 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMX2Q04743 252 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD47Q08722 323 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1Q1Q15612 314 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf128Q5T292 105 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM219Q86XT9 240 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF14Q92956 283 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYDGFQ969H8 173 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC115Q96NT0 180 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM100Q9NV29 134 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF7Q9UBF6 113 aa8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0B4J2E0 115 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GX12 115 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PPL8 197 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OOEPA6NGQ2 149 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNGR1O43759 233 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM13O60858 407 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JTBO76095 146 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT75O95678 551 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CST2P09228 141 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDH12P55289 794 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCBD1P61457 104 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BLCAPP62952 87 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSM1Q08AH1 577 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCLAFQ15004 111 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF74Q16587 644 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM27BQ5VT28 67 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NXNQ6DKJ4 435 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8N2B8 174 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q8TCH9 128 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB10Q8WXI3 467 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT81Q8WYA0 676 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAL2Q969L2 176 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL13Q99616 98 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ECSITQ9BQ95 431 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.23□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PRG6 482 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM247A6NEH6 219 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOK2O60496 412 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPST1O60507 370 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT7P0C024 238 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBG1P23258 451 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCT5P48643 541 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS6P49758 472 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ECH1Q13011 328 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IKZF1Q13422 519 aa8.22□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms