RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533252.1

CASP4-211, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 3

Gene CASP4, Length 215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-211ENST00000533252 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.13□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RELNP78509 3460 aa4.13□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SULT2B1O00204 365 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TNFSF11O14788 317 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TM9SF1O15321 606 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 BIRC5O15392 142 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CLOCKO15516 846 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CXCL13O43927 109 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 KRT75O95678 551 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TGM6O95932 706 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CSTAP01040 98 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PATE4P0C8F1 98 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 UQCRC2P22695 453 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CXCR1P25024 350 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 PTGDSP41222 190 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MAGEA8P43361 318 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MAGEB1P43366 347 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ALDH3A2P51648 485 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ATP5J2P56134 94 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 EMX2Q04743 252 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CHRNB3Q05901 458 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SELENBP1Q13228 472 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 STX3Q13277 289 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RAB35Q15286 201 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 KRT71Q3SY84 523 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GPAT3Q53EU6 434 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 DCST2Q5T1A1 773 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 AGAP6Q5VW22 663 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 KCTD9Q7L273 389 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 FCRLAQ7L513 359 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 C6orf120Q7Z4R8 191 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 FADS6Q8N9I5 356 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GATSQ8NAP1 163 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR4A15Q8NGL6 344 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR5W2Q8NH69 310 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR10D3Q8NH80 312 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CLHC1Q8NHS4 586 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SFXN5Q8TD22 340 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 DDIT4LQ96D03 193 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GIMAP5Q96F15 307 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RNF145Q96MT1 663 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RMND5AQ9H871 391 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RNF121Q9H920 327 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 POLE3Q9NRF9 147 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 MED17Q9NVC6 651 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ZNF225Q9UK10 706 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 LIPT1Q9Y234 373 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 DNAJC13O75165 2243 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SPG11Q96JI7 2443 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 NINQ8N4C6 2090 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 A0A1W2PP18 115 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SERINC4A6NH21 518 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 C5orf58C9J3I9 102 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SCN2BO60939 215 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 ENTPD5O75356 428 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SPAG7O75391 227 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 TNFSF13O75888 250 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 C6orf47O95873 294 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 OPN1LWP04000 364 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SERPINE1P05121 402 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 IL6P05231 212 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 BPGMP07738 259 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 SDC1P18827 310 aa4.11□□□□□ -1.75
CASP4-211ENST00000533252 GGT1P19440 569 aa4.11□□□□□ -1.75
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