RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LY6LH3BQJ8 138 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NVLO15381 856 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCMRO60667 390 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB36O95755 333 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OXTP01178 125 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV1-46P01743 117 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPN2P04844 631 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THRAP10827 490 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COILP38432 576 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LGALS7P47929 136 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT2B15P54855 530 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAS2R43P59537 309 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUCB2P80303 420 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAMTQ14353 236 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLINT1Q14677 625 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL40Q2TBA0 621 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCTD21Q4G0X4 260 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF678Q5SXM1 525 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FA2HQ7L5A8 372 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHDDSQ86SQ9 333 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKAIN4Q8IVV8 208 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COX18Q8N8Q8 333 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STEAP2Q8NFT2 490 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR52N1Q8NH53 320 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTMR9Q96QG7 549 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLCC1Q96S66 551 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXCL16Q9H2A7 254 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRN3Q9H3W5 708 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL26Q9Y258 94 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPTNQ9Y639 398 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL4A2P08572 1712 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APCP25054 2843 aa-0.45□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf16Q68DN1 1984 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYCE3A1L190 88 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYBPHLA2RUH7 354 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRRG1O14668 218 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN3O15551 220 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED7O43513 233 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETS1P14921 441 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB3AP20336 220 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHMLP26374 656 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCR1P32246 355 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CA8P35219 290 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BMI1P35226 326 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGEA3P43357 314 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERFP50548 548 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP24A1Q07973 514 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDK1Q15118 436 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FILIP1LQ4L180 1135 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC80Q76M96 950 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM123Q8N131 208 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KDM8Q8N371 416 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8NAQ8 132 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1J4Q8NGS1 313 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8K3Q8NH51 312 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GHSRQ92847 366 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXorf40BQ96DE9 158 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C14orf79Q96F83 325 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSFY1Q96LI6 401 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V0BQ99437 205 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CWH43Q9H720 699 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF160Q9HCG1 818 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-0.46□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM26A0A096LP01 95 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GU33 70 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IZUMO1RA6ND01 250 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LEUTXA8MZ59 168 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLPP1O14494 284 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FFAR1O14842 300 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HCRTO43612 131 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSX5O60225 188 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENTPD6O75354 484 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA3DO95025 777 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNK2O95069 426 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF43P17038 809 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPS1L1P21108 318 aa-0.47□□□□□ -2.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJB1P25685 340 aa-0.47□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms