RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 ALOX5APP20292 161 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TNFRSF1BP20333 461 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 DTYMKP23919 212 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 DNASE1P24855 282 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 IL13RA2Q14627 380 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 RNF175Q8N4F7 328 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CT55Q8WUE5 264 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 HTRA1Q92743 480 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PPA2Q9H2U2 334 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FAM227AF5H4B4 570 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 K7ESF4 209 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 DFFBO76075 338 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PAHP00439 452 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TNFRSF1AP19438 455 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 HTR2AP28223 471 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 RAB5CP51148 216 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LAPTM4AQ15012 233 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR1C1Q15619 314 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZNF766Q5HY98 468 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LGI3Q8N145 548 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 POC1BQ8TC44 478 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PSMF1Q92530 271 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TMEM203Q969S6 136 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.25□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR2AT4A6NND4 320 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR2J2O76002 312 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 AMY2AP04746 511 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 QDPRP09417 244 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 GABRB1P18505 474 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 MPGP29372 298 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SFTPDP35247 375 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 MGAT2Q10469 447 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NNATQ16517 81 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CDNFQ49AH0 187 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 WNT2BQ93097 391 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 HGDQ93099 445 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FOXB1Q99853 325 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 C5orf51A6NDU8 294 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TNFRSF10AO00220 468 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR2F2O95006 317 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TGM1P22735 817 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CD200P41217 278 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SOX2P48431 317 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR2F1Q13607 317 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SPCS2Q15005 226 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FAM27BQ5VT28 67 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SULF2Q8IWU5 870 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 GALNT16Q8N428 558 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SPICQ8N5J4 248 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 AMER3Q8N944 861 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZNF709Q8N972 641 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NDNFQ8TB73 568 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.24□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms