RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GPRIN2O60269 458 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FADS1O60427 444 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ALOX5APP20292 161 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EMP2P54851 167 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CLDN20P56880 219 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DEFA6Q01524 100 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR7A5Q15622 319 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CLLU1Q5K131 121 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LCN10Q6JVE6 187 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM205Q6UW68 189 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZFP82Q8N141 532 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TEX19Q8NA77 164 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LIPHQ8WWY8 451 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HAS2Q92819 552 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NINJ1Q92982 152 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM106AQ96A25 262 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GSX2Q9BZM3 304 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MED28Q9H204 178 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MOKQ9UQ07 419 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 IFITM5A6NNB3 132 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 A8MVM7 634 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ALOX12BO75342 701 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ITGA10O75578 1167 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SNAPINO95295 136 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 WNT11O96014 354 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RLN2P04090 185 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ADRA2CP18825 462 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HSF2Q03933 536 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FMODQ06828 376 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FGL1Q08830 312 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GRINAQ7Z429 371 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CDC20BQ86Y33 519 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MED29Q9NX70 200 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RARRES3Q9UL19 164 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 B9D1Q9UPM9 204 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 V9GY05 133 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PRSS37A4D1T9 235 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 UBL3O95164 117 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ABHD16AO95870 558 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC12O95881 172 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DMAP28067 261 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A1P30531 599 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 SSPNQ14714 243 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SGCBQ16585 318 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC36A2Q495M3 483 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 Q499Y3 187 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.26□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 COQ8AQ8NI60 647 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C5orf34Q96MH7 638 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EMC6Q9BV81 110 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KCNK15Q9H427 330 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ABI3Q9P2A4 366 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FKBP7Q9Y680 259 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FAM186AA6NE01 2351 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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