RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PRPSAP1Q14558 356 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 OR7A5Q15622 319 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 RNF212Q495C1 297 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.59□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 SH3GL3Q99963 347 aa3.59□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.59□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.59□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.59□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 WIZO95785 1651 aa3.59□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 EPOPA6NHQ4 379 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 HAT1O14929 419 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SCN2BO60939 215 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CBR3O75828 277 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZMPSTE24O75844 475 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 LCA5LO95447 670 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 AIFM1O95831 613 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 IGHV3-23P01764 117 aa3.58□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 UGT2B10P36537 528 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 OR3A4PP47883 348 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CSNK1A1P48729 337 aa3.58□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 CBR4Q8N4T8 237 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.58□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.58□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.58□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 STRCQ7RTU9 1775 aa3.58□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 A0A0G2JLM5 398 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8RI6L899 631 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SULT1B1O43704 296 aa3.57□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SEMG1P04279 462 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 PGAM1P18669 254 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 GGT1P19440 569 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SYT1P21579 422 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 IL32P24001 234 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 COX7A1P24310 79 aa3.57□□□□□ -1.84
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