RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 CD14P08571 375 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 PSMB6P28072 239 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SLC7A9P82251 487 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 RUNX2Q13950 521 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 DHCR24Q15392 516 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 AARDQ4LEZ3 155 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 METRNLQ641Q3 311 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 MTSS1LQ765P7 747 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 LYG2Q86SG7 212 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.16□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 IGKV1D-16P01601 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 THBS1P07996 1170 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 HOXB2P14652 356 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 NDUFB7P17568 137 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CAV2P51636 162 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 ADAM8P78325 824 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SPOCK1Q08629 439 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 RAB11BQ15907 218 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 ZNF383Q8NA42 475 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 TGM7Q96PF1 710 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 RAB33BQ9H082 229 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 F8VVB4 439 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 F8VWA3 439 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 P2RX6O15547 441 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CD63P08962 238 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 FHITP49789 147 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 TFF2Q03403 129 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 ELOCQ15369 112 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 KLHL26Q53HC5 615 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CARFQ8N187 725 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 OR2L3Q8NG85 312 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 OR10G6Q8NH81 332 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 PIGQQ9BRB3 760 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 SYT4Q9H2B2 425 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 UPB1Q9UBR1 384 aa7.15□□□□□ -1.26
TPM3-215ENST00000469717 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 HRKO00198 91 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FGF17O60258 216 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GLCEO94923 617 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 EFEMP2O95967 443 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CD2P06729 351 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 HRH1P35367 487 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ACTBP60709 375 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ACTG1P63261 375 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 PHYHIPQ92561 330 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 PRO1933Q9H354 126 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.15□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 A0A1W2PP55 124 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 URADA6NGE7 173 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FAM157AC9JC47 383 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 VEGFDO43915 354 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 STK17BO94768 372 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 KAT7O95251 611 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FOLR2P14207 255 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 RAB6AP20340 208 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 LAP3P28838 519 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 DEFA6Q01524 100 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 IRF4Q15306 451 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CFAP161Q6P656 301 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FRMD1Q8N878 549 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.14□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GPR148Q8TDV2 347 aa7.14□□□□□ -1.27
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