RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469318.5

DNAJC11-208, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C11, human

TSL 1 (best)

Gene DNAJC11, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNAJC11-208	ENST00000469318	GABARAP	O95166	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ERG	P11308	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PRPS2	P11908	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	GABRR2	P28476	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CCR6	P51684	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	GPR21	Q99679	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	NME4	O00746	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TDP2	O95551	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	IL32	P24001	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	BMI1	P35226	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	SERPINB8	P50452	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	RAB7A	P51149	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PPP1CB	P62140	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	RGN	Q15493	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CENPX	A8MT69	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	MPDU1	O75352	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TPM1	P09493	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TACSTD2	P09758	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	RAB3A	P20336	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PTN	P21246	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	P2RX1	P51575	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ERCC8	Q13216	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TMED1	Q13445	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TFDP2	Q14188	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	RCAN2	Q14206	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318		H7C417	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	GABRP	O00591	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	RAB5A	P20339	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CFHR2	P36980	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	HCAR3	P49019	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ETV1	P50549	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	CDH17	Q12864	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ZNF266	Q14584	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	BMF	Q96LC9	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJC11-208	ENST00000469318	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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