RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 SNCBQ16143 134 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 SLC16A9Q7RTY1 509 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 NINJ1Q92982 152 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 BCL2L14Q9BZR8 327 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 RASSF4Q9H2L5 321 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 HAO2Q9NYQ3 351 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 HTR1FP30939 366 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 SERPINF1P36955 418 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 HCCSP53701 268 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 MST1LQ2TV78 715 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 AGAP6Q5VW22 663 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 RHOXF1Q8NHV9 184 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 CYGBQ8WWM9 190 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 ENTPD6O75354 484 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 ABHD16AO95870 558 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 OCLNQ16625 522 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 C11orf71Q6IPW1 123 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 DHRSXQ8N5I4 330 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 PIGTQ969N2 578 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 VCXQ9H320 206 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 VCX3BQ9H321 246 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRL4Q9HBW9 690 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 CENPMQ9NSP4 180 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 CBLN4Q9NTU7 201 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 CMAHPQ9Y471 501 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-202ENST00000401498 CLIC3O95833 236 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 LCKP06239 509 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 RPS23P62266 143 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 TTC23Q5W5X9 447 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 SPATC1Q76KD6 591 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF454Q8N9F8 522 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 OR1J1Q8NGS3 322 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ABHD4Q8TB40 342 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 RNF133Q8WVZ7 376 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 YIPF3Q9GZM5 350 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ELOVL3Q9HB03 270 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 TBCCD1Q9NVR7 557 aa25.89■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 F5H5K5 113 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 LYNP07948 512 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ALOX5APP20292 161 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 VHLP40337 213 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 SWI5Q1ZZU3 235 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 MEDAGQ5VYS4 303 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ARL9Q6T311 187 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 THEM6Q8WUY1 208 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 RFKQ969G6 155 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ADI1Q9BV57 179 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 FZR1Q9UM11 496 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 VSTM5A8MXK1 200 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF878C9JN71 531 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 OVOL3O00110 214 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ACSM4P0C7M7 580 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 AQP4P55087 323 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 EFNB3Q15768 340 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 NAA40Q86UY6 237 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 MBD6Q96DN6 1003 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 APOL4Q9BPW4 351 aa25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM129A0AVI4 362 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 MPZL2O60487 215 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 SBK2P0C263 348 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF691Q5VV52 312 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 LRP11Q86VZ4 500 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 OR51G2Q8NGK0 314 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 COPS4Q9BT78 406 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 LAMP5Q9UJQ1 280 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 USF3Q68DE3 2245 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1CBP62140 327 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 TMED1Q13445 227 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA46Q5T0L3 261 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 PLK3Q9H4B4 646 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 COPS3Q9UNS2 423 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 STARD10Q9Y365 291 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC168Q8NDH2 2452 aa25.86■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 B9A039 149 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 H0YJX3 145 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF250P15622 560 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 CAPGP40121 348 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 NUDT6P53370 316 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 TAF13Q15543 124 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB113Q30KQ7 82 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 COLCA1Q6ZS62 124 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 RHOUQ7L0Q8 258 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A40Q8TBP6 338 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 APH1BQ8WW43 257 aa25.85■■□□□ 1.73
PKDCC-202ENST00000401498 SPTSSAQ969W0 71 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms