RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 LIPAP38571 399 aa9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PKP4-201ENST00000389757 GLAP06280 429 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SP9P0CG40 484 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 FBXO17Q96EF6 278 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SDSLQ96GA7 329 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OPA3Q9H6K4 179 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TMEM100Q9NV29 134 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 A6NHS1 94 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 B4E171 279 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ABCD4O14678 606 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TFAP2AP05549 437 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TSPAN7P41732 249 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SOX8P57073 446 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 RAB1AP62820 205 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SPINK14Q6IE38 97 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 FAHD1Q6P587 224 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OR10D3Q8NH80 312 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 RASL10BQ96S79 203 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 NRTNQ99748 197 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 JAM3Q9BX67 310 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 CT62P0C5K7 136 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 S100PP25815 95 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 BCL2A1Q16548 175 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 MFFQ9GZY8 342 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 GABRA1P14867 456 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 S100A2P29034 98 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PCK2Q16822 640 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OR56B4Q8NH76 319 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 GCM1Q9NP62 436 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 LRP5LA4QPB2 252 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 APOA2P02652 100 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 FTH1P19P0C7X4 201 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SLC35A2P78381 396 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 DOC2BQ14184 412 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SULT1B1O43704 296 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 CDAP32320 146 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 RNLSQ5VYX0 342 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 WDR54Q9H977 334 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TRIP11Q15643 1979 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SIRPB1O00241 398 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TSPAN15O95858 294 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ECI1P42126 302 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 ZNF141Q15928 474 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PSD2Q9BQI7 771 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 SIAEQ9HAT2 523 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 A0A1W2PPV4 95 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 GREM1O60565 184 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 GABARAPO95166 117 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-201ENST00000389757 CTXN2P0C2S0 81 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms