RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATG10Q9H0Y0 220 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DEFB127Q9H1M4 99 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRN1Q9NPD7 142 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MED29Q9NX70 200 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTRRQ9UBK8 725 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEC14L3Q9UDX4 400 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUP50Q9UKX7 468 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SHROOM2Q13796 1616 aa-2.53□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSME4Q14997 1843 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF222A6NCQ9 220 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SAGE2PA6NJ88 616 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 E7EWF7 191 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDLIM1O00151 329 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLPP3O14495 311 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAMP1O60894 148 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EEDO75530 441 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GFPT2O94808 682 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGLV3-25P01717 112 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHG2P01859 326 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHG4P01861 327 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRHP06850 196 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYP3A5P20815 502 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDH6P55285 790 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC173Q0VFZ6 552 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GK3PQ14409 553 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDK1Q15118 436 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GFOD2Q3B7J2 385 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 STEAP1BQ6NZ63 245 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MOXD1Q6UVY6 613 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf91Q6ZV80 131 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PGAP1Q75T13 922 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GLRX5Q86SX6 157 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM256Q8N2U0 113 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAXEQ8NCW5 288 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR9G1Q8NH87 305 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABHD3Q8WU67 409 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEPT8Q92599 483 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PERPQ96FX8 193 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SGCZQ96LD1 299 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM50BQ9Y247 325 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNE2Q9Y6J6 123 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CADPSQ9ULU8 1353 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRC1P22897 1456 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLASP1Q7Z460 1538 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRP5O75197 1615 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRAPQ86VF7 1730 aa-2.54□□□□□ -2.82
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCER2I3L3R5 266 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 M0R3E3 92 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SYNJ2O15056 1496 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHUKO15111 745 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANGPT2O15123 496 aa-2.55□□□□□ -2.82
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGHV1-46P01743 117 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARG1P05089 322 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP5G1P05496 136 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD70P32970 193 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRLHRP49683 370 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CASP9P55211 416 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLP1P60201 277 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RND3P61587 244 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBE3AQ05086 875 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP1Q07960 439 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLRD1Q13241 179 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDK5R1Q15078 307 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANGPT1Q15389 498 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIP10Q15642 601 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALX1Q15699 326 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BAK1Q16611 211 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-2.55□□□□□ -2.82
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