RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334731.6

C9orf85-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf85, Length 1,279 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-201ENST00000334731 RER1O15258 196 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 UBOX5O94941 541 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 FABP3P05413 133 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 MSMBP08118 114 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 GSTM3P21266 225 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 PCMT1P22061 227 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CRABP1P29762 137 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 RRM2P31350 389 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SLC6A6P31641 620 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 IFNGR2P38484 337 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 GSSP48637 474 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HMGA2P52926 109 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HIST1H3AP68431 136 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CDK5R2Q13319 367 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 MEP1BQ16820 701 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 MTX3Q5HYI7 312 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 GLCCI1Q86VQ1 547 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 OR6V1Q8N148 313 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 FITM2Q8N6M3 262 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 OR4K13Q8NH42 304 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 OR51F2Q8NH61 342 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 FANK1Q8TC84 345 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CMBLQ96DG6 245 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SAMD8Q96LT4 415 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 DIRC2Q96SL1 478 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 NMNAT3Q96T66 252 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TSC22D3Q99576 134 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 OR52D1Q9H346 318 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 B9D1Q9UPM9 204 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 B2RBV5 119 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 KRT36O76013 467 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CD55P08174 381 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 DBHP09172 617 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ANPEPP15144 967 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 KITLGP21583 273 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CENPAP49450 140 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 MXRA7P84157 204 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 BNIP1Q12981 228 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TSPAN31Q12999 210 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 LEG1Q6P5S2 330 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 Q6ZR03 302 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 RINLQ6ZS11 566 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 GJC3Q8NFK1 279 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 RAB1CQ92928 201 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 PTP4A1Q93096 173 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HAVCR1Q96D42 359 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TIMD4Q96H15 378 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 IFT27Q9BW83 186 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 FBN3Q75N90 2809 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 OR6C68A6NDL8 312 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 IDH3BO43837 385 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 RENP00797 406 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 IGHV2-5P01817 119 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 RAC2P15153 192 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ATP6V1B2P21281 511 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 NOS3P29474 1203 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ERFP50548 548 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SLC3A1Q07837 685 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 COX10Q12887 443 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 CORO6Q6QEF8 472 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-201ENST00000334731 NSL1Q96IY1 281 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms