RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 IGHMP01871 453 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 SLC2A1P11166 492 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 FJX1Q86VR8 437 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 SCARB1Q8WTV0 552 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 C11orf40Q8WZ69 217 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXB3-201ENST00000311626 DHRS2Q13268 280 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXB3-201ENST00000311626 ZNF454Q8N9F8 522 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXB3-201ENST00000311626 APCDD1LQ8NCL9 501 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 THRSPQ92748 146 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 SLC5A6Q9Y289 635 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-201ENST00000311626 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXB3-201ENST00000311626 CXADRP78310 365 aa22.58■■□□□ 1.21
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HOXB3-201ENST00000311626 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF546Q86UE3 836 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF584Q8IVC4 421 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 BEST3Q8N1M1 668 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 OR13C9Q8NGT0 318 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf198Q9H425 327 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-201ENST00000311626 FAM25EA8MYX2 175 aa22.58■■□□□ 1.2
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HOXB3-201ENST00000311626 UPB1Q9UBR1 384 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 H3BUI4 141 aa22.57■■□□□ 1.2
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HOXB3-201ENST00000311626 TTLL8A6PVC2 850 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 CD34P28906 385 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-201ENST00000311626 OR1S1Q8NH92 325 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 KLRF1Q9NZS2 232 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 GPR160Q9UJ42 338 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-201ENST00000311626 ANKUB1A6NFN9 424 aa22.56■■□□□ 1.2
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HOXB3-201ENST00000311626 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 CASTOR1Q8WTX7 329 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 ST8SIA4Q92187 359 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 MRGPRFQ96AM1 343 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 FAM206AQ9NX38 181 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 FRYLO94915 3013 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 A6NIZ1 184 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 SYT7O43581 403 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 PRKACBP22694 351 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 MPGP29372 298 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 RAP1BP61224 184 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 RAP1AP62834 184 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.55■■□□□ 1.2
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