RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 PHYHIPQ92561 330 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR35Q9HC97 309 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCB9Q9NP78 766 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 DOCK7Q96N67 2140 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF724A8MTY0 619 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF878C9JN71 531 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS5O15539 181 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 DCTDP32321 178 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF122Q9H9V4 155 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 CALHM2Q9HA72 323 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF84P51523 738 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR148Q8TDV2 347 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 WDFY2Q96P53 400 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 YES1P07947 543 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALT1P15291 398 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB3BP20337 219 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 CADM3Q8N126 398 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM106AQ96A25 262 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 BRD7Q9NPI1 651 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 CMAHPQ9Y471 501 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 V9GYH0 126 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TTRP02766 147 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ISG15P05161 165 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ADRA2CP18825 462 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP5CP53041 499 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM209AQ5JX71 171 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB5Q8WWX0 329 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 AP3S1Q92572 193 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 EMC3Q9P0I2 261 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DKK4Q9UBT3 224 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF3C1Q12789 2109 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 K7ENP7 123 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF4O00268 1085 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 AQP7O14520 342 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NPR2P20594 1047 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF45Q02386 682 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 IDNKQ5T6J7 187 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GJC3Q8NFK1 279 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXB1Q99853 325 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A20A6NK97 555 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 E9PLN8 166 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 EPXP11678 715 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ATF1P18846 271 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKXP51817 358 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms