RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CMBLQ96DG6 245 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 MBD2Q9UBB5 411 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ZNF175Q9Y473 711 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TMEM218A2RU14 115 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 RAB19A4D1S5 217 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CDC14CA4D256 554 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 B4DGG1 531 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 DXOO77932 396 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NUDT14O95848 222 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 GLULP15104 373 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 RAB6AP20340 208 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 MPZP25189 248 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 RORAP35398 523 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ZDHHC22Q8N966 263 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TCTN2Q96GX1 697 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PHB2Q99623 299 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NRSN2Q9GZP1 204 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 OR52A1Q9UKL2 312 aa13.36□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CPED1A4D0V7 1026 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ADCYAP1P18509 176 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CD1CP29017 333 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CTHP32929 405 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 GABRA4P48169 554 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 AKR1C2P52895 323 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 AKR1C1Q04828 323 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 LANCL2Q9NS86 450 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 KCNK7Q9Y2U2 307 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 OR2AT4A6NND4 320 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 LINC01565O15544 149 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NPIPB7O75200 414 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 STK17BO94768 372 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ISG15P05161 165 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CTSEP14091 401 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 MAOBP27338 520 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TMEM151BQ8IW70 566 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 OR5AP2Q8NGF4 316 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 RAB22AQ9UL26 194 aa13.35□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 FREM3P0C091 2139 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 METTL21EPA6NDL7 271 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PLPP3O14495 311 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 FGF16O43320 207 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 GP1BBP13224 206 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 GLO1Q04760 184 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 UNC119Q13432 240 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 FZD2Q14332 565 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 GUCA2BQ16661 112 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CCDC157Q569K6 752 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 SHEQ5VZ18 495 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ZNF813Q6ZN06 617 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 KCTD9Q7L273 389 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 LDLRAD3Q86YD5 345 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NKAIN3Q8N8D7 197 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TSLPQ969D9 159 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PCNX3Q9H6A9 2034 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 LAMA1P25391 3075 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 EFSO43281 561 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 FADS1O60427 444 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 IGHMP01871 453 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 IGKV3-11P04433 115 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 HRH1P35367 487 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ZP2Q05996 745 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 RAB12Q6IQ22 244 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 CHST4Q8NCG5 386 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 ZNF721Q8TF20 911 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 PIK3IP1Q96FE7 263 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 FN3KRPQ9HA64 309 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.34□□□□□ -0.27
SYP-201ENST00000263233 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 P2RY10O00398 339 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 ZNF208O43345 1280 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 SEMA4FO95754 770 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 IGHV4-34P06331 123 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 HLA-DOBP13765 273 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 PGAM2P15259 253 aa13.33□□□□□ -0.28
SYP-201ENST00000263233 AKR1C4P17516 323 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms