RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 CDK10Q15131 360 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 THEM4Q5T1C6 240 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 SCMH1Q96GD3 660 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 GPR87Q9BY21 358 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.09■□□□□ 0.17
USP18-201ENST00000215794 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 AQP7P3A6NL99 342 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DHFRP00374 187 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZNF43P17038 809 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 Q0VFX4 171 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FCN2Q15485 313 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 RAB11BQ15907 218 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 RAET1LQ5VY80 246 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 THRSPQ92748 146 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OXGR1Q96P68 337 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GHITMQ9H3K2 345 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 BEX1Q9HBH7 125 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 HPF1Q9NWY4 346 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FAM206AQ9NX38 181 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 HHLA2Q9UM44 414 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 RABL2BQ9UNT1 228 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.08■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC17A2O00624 439 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 KDM4BO94953 1096 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CD2P06729 351 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TMEM81Q6P7N7 255 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FAM3DQ96BQ1 224 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FLVCR2Q9UPI3 526 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 A0A0G2JMM0 328 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PPB8 328 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PRS3 328 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 C7orf66A4D0T2 115 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 KIR3DP1A8MWS1 328 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SULT1B1O43704 296 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZIC3O60481 467 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CTAG2O75638 210 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ACHEP22303 614 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CD82P27701 267 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CFPP27918 469 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DCTDP32321 178 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SPOCK1Q08629 439 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CLN3Q13286 438 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FAM166AQ6J272 317 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 BEST4Q8NFU0 473 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR6X1Q8NH79 312 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CKLFQ9UBR5 152 aa16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 APC2O95996 2303 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MED13Q9UHV7 2174 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR2M5A3KFT3 312 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 NKX2-8O15522 239 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ISG15P05161 165 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 YES1P07947 543 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 PLA2G5P39877 138 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DNASE1L1P49184 302 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GNG2P59768 71 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC35A1P78382 337 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CHAF1BQ13112 559 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC39A7Q92504 469 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC25A28Q96A46 364 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 C1orf198Q9H425 327 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ING3Q9NXR8 418 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DKKL1Q9UK85 242 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 A0A087WZY1 265 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 XRCC3O43542 346 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TTRP02766 147 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 QDPRP09417 244 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ACSM4P0C7M7 580 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FSTP19883 344 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ANOS1P23352 680 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MNDAP41218 407 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CLDN17P56750 224 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GSG1Q2KHT4 349 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 174.2 ms