RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rcc2Q8BK67 520 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm9938Q8C3P5 112 aa15.48■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Commd1Q8K4M5 188 aa15.48■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa15.48■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SptbP15508 2128 aa15.48■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttc6G3UYY4 1857 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp616J3QN14 987 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Il10P18893 178 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clk1P22518 483 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 LepP41160 167 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr18Q0VAX9 331 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Stoml3Q6PE84 287 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Duoxa1Q8VE49 341 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Alkbh4Q9D8F1 300 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 D17h6s53eQ9Z1R4 293 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp69A2A761 587 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Btbd8D3YUB6 377 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxb9P20615 250 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vipr2P41588 437 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rps27aP62983 156 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Uba52P62984 128 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mboat1Q8BH98 492 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1512Q8VF72 313 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tspan15F7BWT7 294 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GamtO35969 236 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gabrg2P22723 474 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pou3f2P31360 445 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Elavl1P70372 326 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1349Q7TQV1 317 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prss27Q8BJR6 328 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AmtQ8CFA2 403 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Plcxd1Q8CHS4 345 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem63aQ91YT8 804 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Galnt11Q921L8 608 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Clint1Q99KN9 631 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc19a3Q99PL8 488 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r152E9Q9N3 307 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 4930522L14RikE9QAG4 666 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r104L7N293 307 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sstr5O08858 362 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fabp2P55050 132 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1428Q0VDY1 314 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prg2Q61878 223 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc5a7Q8BGY9 580 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Asb16Q8VHS5 453 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Steap4Q923B6 470 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnih4Q9CX13 139 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lypd6bQ9D7F2 191 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TfecQ9WTW4 317 aa15.47■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RbpjlO08674 515 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P06335 190 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HbzP06467 142 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HccsP53702 272 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AhrrQ3U1U7 701 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam196aQ3USH1 422 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kiaa0513Q8R0A7 407 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Best1O88870 551 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmprss9P69525 1065 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q3U6N9 222 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Defb28Q3V2L0 89 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r43Q8VIC9 329 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fhl5Q9WTX7 284 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tp53bp1P70399 1969 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Malrd1A2AJX4 2123 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm12789B1AUV7 164 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Oosp3G5E8D7 195 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bloc1s1O55102 125 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpl27P61358 136 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SlbpP97440 275 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr728Q7TRM6 311 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1163Q8VFR4 316 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr656Q8VGX9 329 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr114Q923Q8 312 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdca5Q9CPY3 264 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc10a6Q9CXB2 373 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa15.46■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Alpk2Q91ZB0 2144 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp300A2AE21 645 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmsb15aA2AEH9 79 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mamdc4A2AJA7 1228 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Htra4A2RT60 483 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r204I7HIK1 302 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Irs3O54718 495 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Igkv7-33P01632 114 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cpne2P59108 548 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SryQ05738 395 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd55Q61475 390 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Med16Q6PGF3 828 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1225Q7TR01 311 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr434Q8VF17 321 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr47Q8VF18 321 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spred1Q924S8 444 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Jam3Q9D8B7 310 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arfgap3Q9D8S3 523 aa15.46■□□□□ 0.06
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mcts1Q9DB27 181 aa15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.3 ms