RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 P2RY10O00398 339 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 EFNA2O43921 213 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF217O75362 1048 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RP2O75695 350 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 PIAS2O75928 621 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RAB3DO95716 219 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 GIMD1P0DJR0 217 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF28P17035 718 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R19P59542 299 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 UNC119Q13432 240 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 OR7A5Q15622 319 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 MPPED2Q15777 294 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CMBLQ96DG6 245 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CMKLR1Q99788 373 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SLC6A7Q99884 636 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 FOXQ1Q9C009 403 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM82A0PJX8 343 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 OR6C76A6NM76 312 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ACTBP60709 375 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ACTG1P63261 375 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ACBD4Q8NC06 268 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 OR1S1Q8NH92 325 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 FAM206AQ9NX38 181 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 HHLA2Q9UM44 414 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.92□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SULT1C2O00338 296 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZP3P21754 424 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CRABP1P29762 137 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SLC38A9Q8NBW4 561 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 AQP3Q92482 292 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CKLFQ9UBR5 152 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 VSIG4Q9Y279 399 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 MTCH2Q9Y6C9 303 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GTI1 187 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 FOSL2P15408 326 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ACHEP22303 614 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 QRFPP83859 136 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZP4Q12836 540 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 MED9Q9NWA0 146 aa11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 OR14I1A6ND48 311 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RLN2P04090 185 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 AMY2AP04746 511 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CD2P06729 351 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RPA2P15927 270 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 FOXF1Q12946 379 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 MED11Q9P086 117 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CA14Q9ULX7 337 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 VDAC3Q9Y277 283 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RAB27BO00194 218 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS8O00214 317 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TTRP02766 147 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 LIPCP11150 499 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 NAXDQ8IW45 347 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CDH26Q8IXH8 852 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A45Q8N413 288 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 PMEPA1Q969W9 287 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.9□□□□□ -0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms