RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 ASB10Q8WXI3 467 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 SAMD8Q96LT4 415 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 MCHR1Q99705 422 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 SIAEQ9HAT2 523 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 NANSQ9NR45 359 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.3□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 MCIDASD6RGH6 385 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 TMEM178BH3BS89 294 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 H3BSA7 217 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 FMO6PO60774 539 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 OPN1SWP03999 348 aa7.29□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 UMPSP11172 480 aa7.29□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 UGT2B15P54855 530 aa7.29□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 Q6YL49 198 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 KLBQ86Z14 1044 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 NSMAFQ92636 917 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 OR52B2Q96RD2 323 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ZNF607Q96SK3 696 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 NANOGQ9H9S0 305 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PRG6 482 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 CENPBD1B2RD01 187 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 SNNO75324 88 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2ABP04908 130 aa7.28□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 TNFRSF1AP19438 455 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 LAP3P28838 519 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 AQP2P41181 271 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 PROK1P58294 105 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 FGF12P61328 243 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 GNB2P62879 340 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 TAF11Q15544 211 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 TAF9Q16594 264 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 DUSP7Q16829 419 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 KRT71Q3SY84 523 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 FAM27BQ5VT28 67 aa7.28□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.28□□□□□ -1.24
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TTR-204ENST00000610404 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 LINC01006Q8NI28 216 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 ZBTB9Q96C00 473 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 C4orf45Q96LM5 186 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 OR2V2Q96R30 315 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-204ENST00000610404 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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