RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	SPARC	P09486	303 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CD53	P19397	219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PSMB9	P28065	219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CDA	P32320	146 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	HCCS	P53701	268 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FAP	Q12884	760 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FOXF2	Q12947	444 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TPBG	Q13641	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MED22	Q15528	200 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FDX2	Q6P4F2	183 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR5M11	Q96RB7	305 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	DOK1	Q99704	481 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MRO	Q9BYG7	248 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	NIPAL2	Q9H841	368 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MSTN	O14793	375 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OGG1	O15527	345 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	INMT	O95050	263 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KRT8	P05787	483 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	COX5A	P20674	150 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TGM4	P49221	684 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SIRPA	P78324	504 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MEP1B	Q16820	701 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TBX5	Q99593	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	APC	P25054	2843 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392		J3QLW9	94 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CCRL2	O00421	344 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PLPP2	O43688	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ABHD16A	O95870	558 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ITGA5	P08648	1049 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PSKH1	P11801	424 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PRF1	P14222	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	CPE	P16870	476 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF19	P17023	458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OPRL1	P41146	370 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RGS6	P49758	472 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR12D2	P58182	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	ECH1	Q13011	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	PELI1	Q96FA3	418 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	C4orf36	Q96KX1	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CELF4-222	ENST00000601392	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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