RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPRY3	O43610	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ICMT	O60725	284 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDC14B	O60729	498 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	LILRA1	O75019	489 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	NCR1	O76036	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	NGF	P01138	241 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MPV17	P39210	176 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAGEA2	P43356	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MS4A2	Q01362	244 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRIP10	Q15642	601 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825		U3KQV3	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	JMJD1C	Q15652	2540 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR6C6	A6NF89	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GNGT2	O14610	69 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	RER1	O15258	196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GYG2	O15488	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GAST	P01350	101 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAP2A	P10114	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	RGS6	P49758	472 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCNI	Q14094	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	HFE	Q30201	348 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	USP51	Q70EK9	711 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCTN6	O00399	190 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GPANK1	O95872	356 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF823	P16415	610 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TNFSF4	P23510	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CRYBB2	P43320	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MEP1B	Q16820	701 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MICA	Q29983	383 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825		J3QW42	95 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CST1	P01037	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TF	P02787	698 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM157C	P0CG43	387 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GAA	P10253	952 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	PCMT1	P22061	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	MMP15	P51511	669 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GK3P	Q14409	553 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC7A6	Q92536	515 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	RAB1C	Q92928	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	CMBL	Q96DG6	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	PITX2	Q99697	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	COQ7	Q99807	217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EFTUD2-215	ENST00000589825	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms