RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-217ENST00000550375 OR51B6Q9H340 312 aa14.9□□□□□ -0.02
BRF1-217ENST00000550375 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.9□□□□□ -0.02
BRF1-217ENST00000550375 FBN2P35556 2912 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SYNGR3O43761 229 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ENTPD6O75354 484 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 HCCSP53701 268 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 AQP4P55087 323 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 IL5RAQ01344 420 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 GALK2Q01415 458 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 HGFACQ04756 655 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 TEX30Q5JUR7 227 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 TTC23Q5W5X9 447 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 VHLLQ6RSH7 139 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SPATC1Q76KD6 591 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 VCX3BQ9H321 246 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SPG11Q96JI7 2443 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 APCP25054 2843 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ITPR2Q14571 2701 aa14.89□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 E7EQL1 145 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 HS3ST1O14792 307 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 FAM157BP0CG42 384 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 CAPGP40121 348 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 PCK2Q16822 640 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SHFQ7M4L6 423 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 LIME1Q9H400 295 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 LRBAP50851 2863 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 DSCAMO60469 2012 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 POLQO75417 2590 aa14.88□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 TACC2O95359 2948 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 OR6C6A6NF89 314 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 MPZL2O60487 215 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 APOL3O95236 402 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 DBHP09172 617 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 COX5BP10606 129 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 GABRB1P18505 474 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 HTR1FP30939 366 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 OCLNQ16625 522 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ZNF691Q5VV52 312 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 RFKQ969G6 155 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 FBXW5Q969U6 566 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ABHD6Q9BV23 337 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 CENPMQ9NSP4 180 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 CLN6Q9NWW5 311 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.87□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 H0YAE9 185 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 NR4A1P22736 598 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 WNT5AP41221 380 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 GGTLC2Q14390 218 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 OTOSQ8NHW6 89 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ST7LQ8TDW4 575 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 THEM6Q8WUY1 208 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 AMELYQ99218 206 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 COQ7Q99807 217 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ATF6BQ99941 703 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.86□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 H0YJX3 145 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 GPRIN2O60269 458 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 GNAO1P09471 354 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 THBS4P35443 961 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ATP6V1E1P36543 226 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 FABP6P51161 128 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 NUDT6P53370 316 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 TAF13Q15543 124 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 SETD9Q8NE22 299 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 NUP37Q8NFH4 326 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 APH1BQ8WW43 257 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 TFAP2CQ92754 450 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 RNFT2Q96EX2 444 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 LURAP1Q96LR2 239 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 Q96MT0 163 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.85□□□□□ -0.03
BRF1-217ENST00000550375 COPS4Q9BT78 406 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms