RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550233.1

TMEM116-211, Transcript of transmembrane protein 116, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TMEM116, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116-211ENST00000550233 NME4O00746 187 aa3.6□□□□□ -1.83
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TMEM116-211ENST00000550233 FAM189A1O60320 539 aa3.6□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
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TMEM116-211ENST00000550233 TRAPPC6AO75865 159 aa3.6□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 RAB3DO95716 219 aa3.6□□□□□ -1.83
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TMEM116-211ENST00000550233 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.6□□□□□ -1.83
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TMEM116-211ENST00000550233 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.59□□□□□ -1.83
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TMEM116-211ENST00000550233 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 CIB1Q99828 191 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 VGLL1Q99990 258 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 COPS4Q9BT78 406 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 C6orf50Q9HD87 102 aa3.59□□□□□ -1.83
TMEM116-211ENST00000550233 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.59□□□□□ -1.83
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