RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542142.1

MMP17-208, Transcript of matrix metallopeptidase 17, human

TSL 4

Gene MMP17, Length 758 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MMP17-208	ENST00000542142	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142		G3V2T6	193 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ABHD16A	O95870	558 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	CLPTM1	O96005	669 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	NGF	P01138	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ACTR3	P61158	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	PPP1CB	P62140	327 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	GINS1	Q14691	196 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	FAM168A	Q92567	244 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ACAN	P16112	2415 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142		H3BSA7	217 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	HMGN1	P05114	100 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF823	P16415	610 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SPI1	P17947	270 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	TUBG1	P23258	451 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	GCH1	P30793	250 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	FMO3	P31513	532 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	CDK5	Q00535	292 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MOG	Q16653	247 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	SLC7A6	Q92536	515 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	COQ7	Q99807	217 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MMP17-208	ENST00000542142	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	TVP23A	A6NH52	213 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	GYPB	P06028	91 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	CLU	P10909	449 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	DAO	P14920	347 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	SLC25A16	P16260	332 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	PDLIM4	P50479	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	DAP	P51397	102 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	BLVRA	P53004	296 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	ECH1	Q13011	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	COG8	Q96MW5	612 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	PITX2	Q99697	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	SMR3A	Q99954	134 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	TPK1	Q9H3S4	243 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	MTOR	P42345	2549 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142		J3QW42	95 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	NDUFS8	O00217	210 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	SURF4	O15260	269 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	MT-ND5	P03915	603 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	DBH	P09172	617 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	NAT2	P11245	290 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	ZNF23	P17027	643 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	MPV17	P39210	176 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	RGS6	P49758	472 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MMP17-208	ENST00000542142	CRISP1	P54107	249 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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