RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529404.5

FADS3-208, Transcript of fatty acid desaturase 3, human

TSL 2

Gene FADS3, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS3-208	ENST00000529404	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
FADS3-208	ENST00000529404	FREM3	P0C091	2139 aa		13.52	□□□□□ -0.24
FADS3-208	ENST00000529404		A0A0A6YYH2	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404		A6NJ64	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	TOX	O94900	526 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CD3D	P04234	171 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	BID	P55957	195 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	P2RX3	P56373	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ACTB	P60709	375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	TSPAN5	P62079	268 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ACTG1	P63261	375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SNTA1	Q13424	505 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	MYOT	Q9UBF9	498 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404		H3BML4	177 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LMX1B	O60663	402 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	DKK1	O94907	266 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LPL	P06858	475 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	HLA-C	Q95604	372 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	P2RY10	O00398	339 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SNAPC5	O75971	98 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	IFNA7	P01567	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	P2RY4	P51582	365 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	MYBPH	Q13203	477 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SAP25	Q8TEE9	199 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	RBP7	Q96R05	134 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LAMA1	P25391	3075 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SIGLEC6	O43699	453 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ACSM4	P0C7M7	580 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	FOSL1	P15407	271 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	TAS2R19	P59542	299 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ITGB2	P05107	769 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	RAB6A	P20340	208 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LAP3	P28838	519 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	GRK1	Q15835	563 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CLLU1	Q5K131	121 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	OR2J2	O76002	312 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	TTR	P02766	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
FADS3-208	ENST00000529404	CYC1	P08574	325 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms