RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		V9GY05	133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		V9GYY9	64 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPAN11	A1L157	253 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		K7ENP7	123 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FKBP6	O75344	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN11	O75508	207 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CBR3	O75828	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LCA5L	O95447	670 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TDP2	O95551	362 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF250	P15622	560 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TBP	P20226	339 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NTS	P30990	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT2B10	P36537	528 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ3	P48549	501 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2K	P61086	200 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SELENOT	P62341	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SP4	Q02446	784 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPRE2	Q15555	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PSG3	Q16557	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CNIH2	Q6PI25	160 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SYS1	Q8N2H4	156 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CPB2	Q96IY4	423 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBP1	Q9H171	429 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RAD50	Q92878	1312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GVY2	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PQ72	361 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NIZ1	184 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A8MX80	341 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SC5D	O75845	299 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL2	O95198	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	VAPB	O95292	243 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	GJB5	O95377	273 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM49	P0CI25	452 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM49C	P0CI26	452 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NEFH	P12036	1026 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	BGN	P21810	368 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCR2	P25025	360 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IVD	P26440	423 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CD40LG	P29965	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	AQP2	P41181	271 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KLK7	P49862	253 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RORC	P51449	518 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RAP1B	P61224	184 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CD300C	Q08708	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PGGHG	Q32M88	737 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX31	Q8N9S9	440 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CDKL2	Q92772	493 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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