RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	TGM4	P49221	684 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GPR141	Q7Z602	305 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KLB	Q86Z14	1044 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SNX33	Q8WV41	574 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PSMD9	O00233	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MSTN	O14793	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KRT8	P05787	483 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CD1A	P06126	327 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF32	P17041	273 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	DCTD	P32321	178 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OPRM1	P35372	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RGS6	P49758	472 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TAS2R43	P59537	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GPR50	Q13585	617 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CDK5R1	Q15078	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GABRA6	Q16445	453 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CCDC58	Q4VC31	144 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	LIPN	Q5VXI9	398 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PHC2	Q8IXK0	858 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GJC3	Q8NFK1	279 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PIGM	Q9H3S5	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	LRP12	Q9Y561	859 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394		H3BSA7	217 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CCRL2	O00421	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PLPP2	O43688	288 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SYNGR3	O43761	229 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	HSMCR30	P0CW71	290 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CRYGS	P22914	178 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PSG4	Q00888	419 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	P2RY6	Q15077	328 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RAB35	Q15286	201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KRT77	Q7Z794	578 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF75A	Q96N20	296 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	DOK1	Q99704	481 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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