RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRA4	P48169	554 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB28	P51157	221 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARFRP1	Q13795	201 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM3C	Q92520	227 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GLYATL1	Q969I3	302 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC22A12	Q96S37	553 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEAD3	Q99594	435 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMO	Q99835	787 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NMES1	Q9C002	83 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM100	Q9NV29	134 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AQP7P3	A6NL99	342 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF727	A8MUV8	499 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BSH0	61 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7BYZ3	331 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCMR	O60667	390 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD5	P06127	495 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPZ	P25189	248 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACVRL1	P37023	503 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFSF10	P50591	281 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BACE1	P56817	501 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERVFRD-1	P60508	538 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPGS2	Q68CL5	300 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51A7	Q8NH64	312 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NFKBIE	O00221	500 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHE	P01854	428 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN6	P56747	220 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB11A	P62491	216 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMER3	Q8N944	861 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf50	Q96LR7	162 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARID1A	O14497	2285 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC16A5	O15375	505 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBX19	O60806	448 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTNS	O60931	367 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC2A10	O95528	541 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPPP2	P59282	170 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAS2R38	P59533	333 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DRB3	P79483	266 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MC1R	Q01726	317 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF44	Q7L0R7	432 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF709	Q8N972	641 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM46B	Q96A09	425 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSRA	Q9UJ68	235 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DVL2	O14641	736 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FFAR1	O14842	300 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GYPB	P06028	91 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5G3	P0C626	314 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGA3	P0DJD8	388 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BMP5	P22003	454 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB2A2	Q13296	93 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DLK2	Q6UY11	383 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		7.44	□□□□□ -1.22

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