RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 A6NDN8 102 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 PRPS2P11908 318 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 GZMAP12544 262 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MSR1P21757 451 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 19.8
PTPRC-212ENST00000491302 SEMG2Q02383 582 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC3Q13217 504 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CHRFAM7AQ494W8 412 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CBR4Q8N4T8 237 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CHST4Q8NCG5 386 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TPK1Q9H3S4 243 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ASTN1O14525 1302 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 A0A096LNJ9 63 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 BCKDKO14874 412 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL7O43827 346 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ATF6P18850 670 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 PEX19P40855 299 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MECOMQ03112 1051 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 FAM92BQ6ZTR7 304 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF786Q8N393 782 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF596Q8TC21 504 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RGCCQ9H4X1 137 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 FANCEQ9HB96 536 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 LHX9Q9NQ69 397 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CTSFQ9UBX1 484 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf94C9JXX5 98 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG7O75391 227 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 RAB3AP20336 220 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 P2RX1P51575 399 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2SQ16763 222 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD3Q8WU67 409 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 FOXC2Q99958 501 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IL22Q9GZX6 179 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 ACP6Q9NPH0 428 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR6C74A6NCV1 312 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RDH16O75452 317 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 HPRT1P00492 218 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ERGP11308 486 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PRKACAP17612 351 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CD82P27701 267 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RFC3P40938 356 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DAOAP59103 153 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CDH17Q12864 832 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RGNQ15493 299 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NPWQ8N729 165 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N9L7 120 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF681Q96N22 645 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CALN1Q9BXU9 219 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 K7EMT4 169 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 XRCC2O43543 280 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 LONP1P36776 959 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SLC11A1P49279 550 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1CBP62140 327 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ART3Q13508 389 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PON2Q15165 354 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 MYOCDQ8IZQ8 938 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A5Q96R48 311 aa4.95□□□□□ -1.62
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