RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 MEP1BQ16820 701 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NRN1LQ496H8 165 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 FGD3Q5JSP0 725 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 USP51Q70EK9 711 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PYURFQ96I23 114 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 C4orf45Q96LM5 186 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CDRT15Q96T59 188 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RERGLQ9H628 205 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MSL2Q9HCI7 577 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MRGBPQ9NV56 204 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PRSS37A4D1T9 235 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 UNC119BA6NIH7 251 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SOCS2O14508 198 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ATP8B1O43520 1251 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC16A7O60669 478 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP1R3DO95685 299 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PTHP01270 115 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 IFNA2P01563 188 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 GAAP10253 952 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SRD5A1P18405 259 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RHCEP18577 417 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MSR1P21757 451 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ACHEP22303 614 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CRYBB2P43320 205 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF81P51508 661 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM33P57088 247 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP1CBP62140 327 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 TAF11Q15544 211 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 Q6ZR03 302 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NAA40Q86UY6 237 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ABHD4Q8TB40 342 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.2□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 B9D1Q9UPM9 204 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 DYSFO75923 2080 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PRQ8 180 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 A6NIZ1 184 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RER1O15258 196 aa6.19□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 UBOX5O94941 541 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 NDUFB2O95178 105 aa6.19□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 HTR5AP47898 357 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CENPAP49450 140 aa6.19□□□□□ -1.42
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PRPF4B-208ENST00000490653 RAP1AP62834 184 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 SPIBQ01892 262 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 DGCR6Q14129 220 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CORO6Q6QEF8 472 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 RINLQ6ZS11 566 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5AS1Q8N127 324 aa6.19□□□□□ -1.42
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6V1Q8N148 313 aa6.19□□□□□ -1.42
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