RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	IGHM	P01871	453 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CD14	P08571	375 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF35	P13682	527 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ANXA8	P13928	327 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ACADS	P16219	412 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OMG	P23515	440 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RAD52	P43351	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ERVK-25	P63136	954 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CCL8	P80075	99 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GALK2	Q01415	458 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PIGF	Q07326	219 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	COX10	Q12887	443 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GSG1	Q2KHT4	349 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SYT14	Q8NB59	555 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OR52D1	Q9H346	318 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SLC6A6	P31641	620 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	STMN2	Q93045	179 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344		A6NIZ1	184 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	C17orf100	A8MU93	164 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CLDN25	C9JDP6	229 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344		M0R3G1	203 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IGHG1	P01857	330 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PGA4	P0DJD7	388 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PGA3	P0DJD8	388 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CLRN1	P58418	232 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RAP1B	P61224	184 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RAP1A	P62834	184 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TIMD4	Q96H15	378 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344		Q96M85	177 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GAL3ST1	Q99999	423 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	MMP27	Q9H306	513 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CACNG2	Q9Y698	323 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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