RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 SOX2P48431 317 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 LHX2P50458 406 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 RRADP55042 308 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF846Q147U1 533 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 HIST3H3Q16695 136 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF766Q5HY98 468 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 WDR38Q5JTN6 314 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 LAX1Q8IWV1 398 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 DTX3Q8N9I9 347 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR6X1Q8NH79 312 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 FNDC8Q8TC99 324 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ST7LQ8TDW4 575 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ABHD3Q8WU67 409 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 BORCS5Q969J3 196 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM54Q969K7 222 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 MCHR2Q969V1 340 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM19Q96E16 107 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 RBP7Q96R05 134 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR8B4Q96RC9 309 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ATF6BQ99941 703 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 MED18Q9BUE0 208 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ABCB9Q9NP78 766 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CENPMQ9NSP4 180 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 LRP12Q9Y561 859 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.41□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 FREM1Q5H8C1 2179 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 A0A0G2JK05 382 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 GJE1A6NN92 205 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CENPBD1B2RD01 187 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 RGS5O15539 181 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 LMX1BO60663 402 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 HPGDSO60760 199 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SC5DO75845 299 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SULT1C4O75897 302 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 AQP8O94778 261 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF432O94892 652 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 TACSTD2P09758 323 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CD40LGP29965 261 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CSNK1A1P48729 337 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 TNFSF10P50591 281 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CLDN18P56856 261 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SOX8P57073 446 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 RAC3P60763 192 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 GLO1Q04760 184 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 EGR3Q06889 387 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 IKZF1Q13422 519 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SGCAQ16586 387 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 PCK2Q16822 640 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CEP78Q5JTW2 689 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 THEM4Q5T1C6 240 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 IDNKQ5T6J7 187 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 C16orf87Q6PH81 154 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 LINGO2Q7L985 606 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 KRT77Q7Z794 578 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM123Q8N131 208 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR52N5Q8NH56 324 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 S100ZQ8WXG8 99 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 SCMH1Q96GD3 660 aa5.4□□□□□ -1.54
SKAP2-204ENST00000481204 C4orf45Q96LM5 186 aa5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms