RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	PYCR1	P32322	319 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF81	P51508	661 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	HMGA2	P52926	109 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TEK	Q02763	1124 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CCNI	Q14094	377 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR6V1	Q8N148	313 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF786	Q8N393	782 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GIPC3	Q8TF64	312 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	WAC	Q9BTA9	647 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CHODL	Q9H9P2	273 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C68	A6NDL8	312 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	AQP12B	A6NM10	295 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf100	A8MU93	164 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ACOT8	O14734	319 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	DBH	P09172	617 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	COX5B	P10606	129 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	COL8A2	P25067	703 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	POU1F1	P28069	291 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GZMK	P49863	264 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GJC3	Q8NFK1	279 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RDH5	Q92781	318 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PITX2	Q99697	317 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	YY1AP1	Q9H869	796 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TVP23A	A6NH52	213 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	VWC2L	B2RUY7	222 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	NCR1	O76036	304 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IFNG	P01579	166 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-13	P01766	116 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	GAA	P10253	952 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF23	P17027	643 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CHN2	P52757	468 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CBX1	P83916	185 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TRIP10	Q15642	601 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T33	Q8NG76	320 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T4	Q8NH00	348 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	FEV	Q99581	238 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	MSL2	Q9HCI7	577 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	TREM2	Q9NZC2	230 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	POMP	Q9Y244	141 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C6	A6NF89	314 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880		F5H5K5	113 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	BHLHE40	O14503	412 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TF	P02787	698 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GYPB	P06028	91 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ACHE	P22303	614 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RASSF2	P50749	326 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	KCNMB1	Q16558	191 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	USP51	Q70EK9	711 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	YIPF5	Q969M3	257 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	POFUT1	Q9H488	388 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	IL20	Q9NYY1	176 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		12.64	□□□□□ -0.39

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