RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CXorf58Q96LI9 332 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OR4F4Q96R69 305 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 PI4KAP42356 2102 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 HS3ST1O14792 307 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 EFSO43281 561 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 IL2RAP01589 272 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OPN1LWP04000 364 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 STAG3L2P0CL84 134 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ABCD3P28288 659 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 MED18Q9BUE0 208 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GSX2Q9BZM3 304 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ITGB4P16144 1822 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 J3KTA2 159 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SULT1C4O75897 302 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 C1QBP02746 253 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 C1SP09871 688 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 PVRP15151 417 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 NTF3P20783 257 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 PSMB6P28072 239 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 NPY4RP50391 375 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ADPRHP54922 357 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 VAMP3Q15836 100 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ST8SIA1Q92185 356 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CHST8Q9H2A9 424 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 AQP7O14520 342 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ALOX12BO75342 701 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GCSHP23434 173 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CTSCP53634 463 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 NTHL1P78549 312 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CDH26Q8IXH8 852 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ARHGDIGQ99819 225 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 UBQLN3Q9H347 655 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LANCL2Q9NS86 450 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.12□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 OR5G3P0C626 314 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CYBAP13498 195 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GNB1P62873 340 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OPALINQ96PE5 141 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.12□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LINC01387J3KSC0 135 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GNB2P62879 340 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LPAL2Q16609 132 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 GPX8Q8TED1 209 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 WBP2Q969T9 261 aa6.11□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 SRRQ9GZT4 340 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 TJP1Q07157 1748 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 DOCK7Q96N67 2140 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 PRSS44E7EML9 344 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OR13C7P0DN81 318 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 DDOSTP39656 456 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CCL11P51671 97 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SEMA3BQ13214 749 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 SELENBP1Q13228 472 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OR51F2Q8NH61 342 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 TMEM230Q96A57 120 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.11□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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