RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 TATDN3Q17R31 274 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ACER2Q5QJU3 275 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 C10orf128Q5T292 105 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 OTPQ5XKR4 325 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 GLT8D1Q68CQ7 371 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM166AQ6J272 317 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 MDGA2Q7Z553 956 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2J2Q8N2K1 259 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 UPRTQ96BW1 309 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM206AQ9NX38 181 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0B4J293 547 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PPL8 197 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF878C9JN71 531 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CAPZA1P52907 286 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 AP3S2P59780 193 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CBX3Q13185 183 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM54Q969K7 222 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 BTCP35070 178 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 RAG2P55895 527 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 OPN1LWP04000 364 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 PTH2RP49190 550 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 B3GALT5-AS1P59052 145 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB11BQ15907 218 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ODF4Q2M2E3 257 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM69Q5SWH9 247 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DNM1P46Q6ZS02 220 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DTX3Q8N9I9 347 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ST6GAL2Q96JF0 529 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 QDPRP09417 244 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CD3GP09693 182 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CYB561P49447 251 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CLDN12P56749 244 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 HES3Q5TGS1 186 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LINGO2Q7L985 606 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT74Q7RTS7 529 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 SIAH3Q8IW03 269 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 IP6K3Q96PC2 410 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CENPMQ9NSP4 180 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 GLTPQ9NZD2 209 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LAMA5O15230 3695 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ACOT7O00154 380 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK2AP1O14519 115 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 XRCC3O43542 346 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 RAMP1O60894 148 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT33AO76009 404 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 GSTT2BP0CG30 244 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CLDN17P56750 224 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 BEST3Q8N1M1 668 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2B2Q9GZK3 357 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 ALG5Q9Y673 324 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRBP23467 1997 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01387J3KSC0 135 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 GDNFP39905 211 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 CSNK1A1P48729 337 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-202ENST00000435136 DNASE1L1P49184 302 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms