RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364243.1

RNU6-647P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 647, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-647P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-647P-201ENST00000364243 GSDMCQ9BYG8 508 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 PRORYQ9H606 182 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 RHBDL2Q9NX52 303 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 HMG20BQ9P0W2 317 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 DDX19BQ9UMR2 479 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 POLEQ07864 2286 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 NCKAP5O14513 1909 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 HERC1Q15751 4861 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 RYR3Q15413 4870 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 A0A0U1RQV5 110 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 LRP5LA4QPB2 252 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 H3BQ85 93 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 H3BRN7 92 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 FIBPO43427 364 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 PSCAO43653 123 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 VEGFDO43915 354 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 SLC19A2O60779 497 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 AP2A1O95782 977 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 OXTP01178 125 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 CTSLP07711 333 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 CCNB1P14635 433 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 RAB3BP20337 219 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 KIF5BP33176 963 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 MAGEA12P43365 314 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 RCAN2Q14206 197 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 LDLRAP1Q5SW96 308 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 Q6ZRU5 148 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 GRINAQ7Z429 371 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 ANKRD23Q86SG2 305 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 CCDC65Q8IXS2 484 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 BCORP1Q8N888 145 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 FAM71CQ8NEG0 241 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 PYROXD1Q8WU10 500 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 FCGR1BQ92637 280 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 EEF2KMTQ96G04 330 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 VSIRQ9H7M9 311 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 CYP39A1Q9NYL5 469 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 TMED5Q9Y3A6 229 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-647P-201ENST00000364243 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 OR5B21A6NL26 309 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 GABRR3A8MPY1 467 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 A8MXQ7 604 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 CLDN5O00501 218 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 NEBLO76041 1014 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 TM7SF2O76062 418 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGHV2-5P01817 119 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGKV5-2P06315 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 MAGEA8P43361 318 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 CDKN2DP55273 166 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 SIGLEC14Q08ET2 396 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 MERTKQ12866 999 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 C1orf61Q13536 156 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 SCARB2Q14108 478 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 C10orf120Q5SQS8 335 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 OR6B2Q6IFH4 312 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 ACOT1Q86TX2 421 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 SLC35F2Q8IXU6 374 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 EID2Q8N6I1 236 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 B3GNT7Q8NFL0 401 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 OR10T2Q8NGX3 314 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 GALNT14Q96FL9 552 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 HIGD2AQ9BW72 106 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 MEAF6Q9HAF1 191 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 MTRRQ9UBK8 725 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 AURKCQ9UQB9 309 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 CCL26Q9Y258 94 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 NUDCQ9Y266 331 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 HERC2O95714 4834 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 ZANQ9Y493 2812 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 CREBBPQ92793 2442 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IGHV1-46P01743 117 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 RPN2P04844 631 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 LDHCP07864 332 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 HMOX1P09601 288 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 IMPDH1P20839 514 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 NT5EP21589 574 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-647P-201ENST00000364243 SLC2A5P22732 501 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms