RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFP02787 698 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYNX1P0DP58 116 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 LNX2Q8N448 690 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1F12Q8NHA8 337 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX33Q8WV41 574 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A6Q92536 515 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 JMJD1CQ15652 2540 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf100A8MU93 164 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BSA7 217 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD16AO95870 558 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCH1P30793 250 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEB1P43366 347 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERFP50548 548 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX10Q12887 443 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIN1Q13671 783 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CORO6Q6QEF8 472 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf174Q8IYL3 243 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIPC3Q8TF64 312 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 POFUT1Q9H488 388 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR160Q9UJ42 338 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP6O75344 327 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGDIAP52565 204 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2R2BQ00005 443 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEKQ02763 1124 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL9Q6T311 187 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 FEVQ99581 238 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAIAP2Q9UQB8 552 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNGT2O14610 69 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 DBHP09172 617 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYCR1P32322 319 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGT2P36268 569 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP15P51511 669 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX1P83916 185 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOGQ16653 247 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC36A3Q495N2 470 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC18B1Q6NT16 456 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJC3Q8NFK1 279 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T33Q8NG76 320 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDH5Q92781 318 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 YIPF5Q969M3 257 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ7Q99807 217 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DQA2P01906 255 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACSTD2P09758 323 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF23P17027 643 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACHEP22303 614 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL8A2P25067 703 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRMP1Q14194 572 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIP10Q15642 601 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T4Q8NH00 348 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 YY1AP1Q9H869 796 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHODLQ9H9P2 273 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.8 ms